沙巴交通便利，有多个机场提供国际航班和马来西亚国内的航班，航线覆盖了国际国内的大中城市。沙巴当地的大巴、小巴和出租车很多，前往景点交通便利。

飞机

1、【亚庇国际机场（BKI，Kota Kinabalu International Airport，既KKIA，也称为terminal 1）】

这是马来西亚第2大国际机场，是沙巴最大的机场。主要供国际班次航机和马来西亚航空公司班机起降使用。

从机场搭乘出租车到亚庇市区，可在出口处的柜台办理，说明目的地并购票，车资约20林吉，时间大约15分钟。

2、【亚庇廉价航空机场(LCCT，也称为Terminal 2)】

就是俗称的国内机场，主要供亚洲航空公司的班机起降。因此如果要飞吉隆坡或沙巴的斗湖、山打根、古达等都可以在这里搭乘航班。机场内有计程车柜台可以购票乘搭汽车到市区各处。

3、【斗湖国际机场(TWU，Tawau International Airport)】

机场位于东马来西亚沙巴州斗湖市31公里以东的沿海地区。提供航班服务的航空公司有马来西亚航空公司、亚洲航空公司和沙巴航空公司。国内航线飞往亚庇、山打根和吉隆坡。

斗湖机场有24小时的计程车服务载游客到仙本那镇，单程费用大约是95林吉每车(可坐4人)，也可以乘坐到斗湖市的巴士到达市区，巴士运营时间为8:00-17:00。

【去机场：】要前往机场的乘客可在市区大型商场附近找到出租车站，搭乘出租车前往。另外，很多饭店宾馆也有送客到机场的服务，可以咨询前台。

【去市区：】从机场到市区有机场大巴，每天早上6点到晚上9点半都有提供，行程大约25分钟，票价为RM1。也可以乘坐出租车，花费大约在RM12，晚上可能会更贵。

火车

沙巴拥有东马来西亚婆罗洲唯一的火车线路。火车的总站位于离亚庇市10公里的丹容亚路(Tanjung Aru)。可以乘坐火车到达丹南(Tenom)，途中会经过Putatan、Kinarut、吧巴镇 (Papar)、Kawang、Kimanis、Bongawan、Membakut、保佛镇(Beaufort)、Rayoh和Pangi等市镇。